现代医学证明，果实含番木瓜碱、木瓜蛋白酶、凝乳酶、胡萝卜素等，并富含17种以上氨基酸及多种营养元素。

其中所含的齐墩果成分是一种具有护肝降酶、抗炎抑菌、降低血脂等功效的化合物。木瓜中维生素C的含量是苹果的48倍，具有很强的抗氧化能作用。

研究发现，木瓜具有阻止人体致癌物质亚硝胺合成和提高人体免疫力的作用。世界艾滋病研究与防治基金会主席吕克·蒙塔尼耶指出，木瓜汁中含有一些可以提高人体免疫力和抗氧化能力的物质。具有抗癌和预防感冒等疾病的作用。