苹果的砧木可分为矮化砧木和乔化砧木两大类。矮化砧木亦有极矮化、矮化、半矮化等类型，如，现在应用较多、适应性、亲和性较强、矮化性能较好的SH3、SH6、SH38、SH40、SL系列，以及M7、M9、M26、MM106等东茂林系列。乔化砧木也有很多类群，如，河北怀来的八棱海棠、河南海棠、湖北海棠、新疆海棠、山定子等。

在苹果盆景生产过程中，使用矮化砧木可以使盆树树体相对矮小并提早开始结果的年限，缩短盆树养护周期，提早上市销售时间，降低养护成本，加快资金周转，提高盆景生产企业的经济效益，具有十分重要的意义。但值得提出的是，绝不是单纯利用矮化砧木就能达到盆树提早结果的，这只是使果树在盆中提早结果的一个重要条件，还必须加强其他栽培管理技术措施。

选择利用矮化砧木时，如果选用接穗与砧木的组合不当，可以使盆树树体出现小脚现象，虽然往往使其更容易形成花芽，也不影响盆树的结果，但容易造成盆树结果过量，大小年开花结果现象发生。并且由于树干上粗下细、协调性失衡，观赏价值下降。

苹果的乔化砧木类型也很多，选用不同类型的砧木，即使嫁接同一品种，其生长和结实的表现也不大一样。同一砧木嫁接不同的苹果品种，也表现各异。如树体的大小、生长的强弱、结果性能、结果的年限、抗病性等都各有不同的表现。乔化砧木的果树进入盛果期的时间比矮化砧木要晚，但乔化砧木的寿命比较长。据笔者观察发现：乔砧苹果盆景，在盆中生长结果20年以上，仍然老当益壮、风华正茂、生机盎然。

砧木是果树盆景赖以生活的物质基础，不同砧木和不同品种间的组合表现也不一样。无论选用哪种砧∕穗组合形式，只要综合技术措施管理得当，都可以使树体矮小紧凑，在盆中年年开花结果正常。但是，要想培育出高层次的苹果盆景，必须选用乔化砧木类型，因为所有矮化砧木的根系都须根多而粗根少，比较脆硬，不容易提根露爪，在艺术加工上不理想。这就是砧∕穗组合的多样性，只有在生产实践中不断探索才能选出适合制作成精品的素材。如选用根系强大、适应性强的河北怀来的八棱海棠做根砧、矮化砧木SH40做中间砧，其上嫁接优良短枝富士，既能使树体生长势中庸，成花易、结果早，也能消除矮化砧根系弱的弊端，形成最佳的砧∕穗组合。